Basicamente os morcegos neotropicais possuem quatro padrões de reprodução:
Morcegos que se reproduzem
apenas uma vez por ano;
Morcegos que se reproduzem
mais de uma vez por ano;
Morcegos que se reproduzem
por um longo período do ano, com um curto período de inatividade
sexual;
Morcegos que se reproduzem
continuamente durante todo ano.
Os morcegos apresentam uma gestação de dois a sete meses, dependendo da espécie. Os insetívoros têm um período de gestação de dois a três meses, enquanto que os fitófagos (frugívoros e polinívoros), em torno de três a cinco meses. O mais longo período de gestação pertence aos morcegos hematófagos, tendo uma gestação em torno de sete meses. Os filhotes (geralmente um por gestação) nascem sem pêlos ou com uma pelagem tênue. Estes em seus primeiros meses de vida, são alimentados com leite materno e, gradativamente, começam a ingerir o mesmo alimento dos adultos.